申请软件产品登记证书的好处如下：

1、进行软件产品登记可以显示企业技术实力和市场价值，有利于提升企业形象和无形资产价值；

2、软件产品登记后，可以凭此办理后续软件企业认定手续，取得软件企业认定证书；

3、软件产品登记后，有助于企业承接工程项目，参加招投标，促进项目成交和市场营销；

4、软件产品登记后，可以获得投资者信心和消费者放心，对企业融资、获得贷款、拨款和市场营销都有好处；

5、软件产品经登记后，可以获得税收等方面的优惠；

6、软件产品经登记后，有助于将其区分于恶意软件和流氓软件，有助于打击恶意软件和流氓软件的发展。